O impacto das doenças infecciosas à saúde animal e vegetal é progressivamente marcante devido a um aumento na resistência bacteriana e fúngica e na redução da descoberta de novos tratamentos. Com isso, busca-se desenvolver e caracterizar antimicrobianos produzidos por bactérias isoladas durante um projeto realizado em 2023, onde foram cultivados e isolados microrganismos originários do mel, e partindo de ensaios de halo de inibição, selecionado os micróbios capazes de secretar antifúngicos e antibióticos. Este projeto visa continuar a validação fenotípica de organismos isolados, além de realizar o sequenciamento dos micróbios e a identificação dos genes responsáveis pela síntese dessas substâncias a partir do desenvolvimento de pipeline computacional, visando no futuro desenvolver microrganismos com maior capacidade de produção de antimicrobianos. Para testar a atividade antifúngica dos microrganismos, eles foram testados em ensaios de halos de inibição contra a bactéria Xanthomonas citri e diversos fungos fitopatogênicos. Para a extração de DNA genômico da bactéria isolada com melhor atividade antimicrobiana, foi utilizado o kit Wizard® Genomic DNA Purification Kit da Promega; para o preparo de biblioteca de DNA para sequenciamento por Nanoporo, foi utilizado o Ligation Sequencing Kit da Oxford Nanopore Technologies; para o preparo e carregamento da flow cell para sequenciamento por Nanoporo, foi utilizado o protocolo Flow Cell Priming Kit da Oxford Nanopore Technologies e seguido as instruções no software para proceder com o sequenciamento; para a detecção de variantes, alinhamento e análise dos dados brutos, se empregará o uso do software EPI2ME e o guia: https://github.com/baynec2/nanopore_pipelines, que engloba códigos que auxiliarão na montagem e anotação do novo genoma; após a montagem do novo genoma e busca por genomas já publicados de linhagens semelhantes às isoladas do mel, os genomas serão submetidos à plataforma antiSMASH. Com os experimentos realizados verificou-se que diversos dos isolados possuem diferentes padrões de resistência antibiótica. Portanto, espera-se montar um código capaz de receber os dados brutos de sequenciamento, montar e anotar o genoma. Assim, contribuindo com o projeto para ajudar a descobrir os genes responsáveis pela secreção antimicrobiana, para posteriormente proporcionar o aumento da capacidade produtiva dos microrganismos cultivados.

PALAVRAS-CHAVE: Antimicrobiano. Genotipagem. Sequenciamento. Software.